Awal mula berdirinya stanbrain yaitu sejak tahun 2011, yang dibentuk oleh beberapa alumni dari kampus PKN STAN dengan tujuan membuat sebuah pelatihan bimbingan belajar dan menerapkan metode belajar yang efektif untuk mempersiapkan diri menghadapi Seleksi Penerimaan Mahasiswa Baru di Kampus Politeknik Keuangan Negara STAN (PKN STAN). Metode belajar tersebut merupakan metode belajar baru yang dikenal sebagai Metode Brainways. Metode ini digunakan sebagai solusi dalam menghadapi berbagai soal SPMB PKN STAN dengan cepat dan benar dalam hitungan detik.

Pada tahun 2013, perusahaan ini di kembangkan kembali oleh Fredy Napitupulu dengan cara take over bisnis milik seniornya. Fredy sendiri merupakan salah satu alumni di Politeknik Keuangan Negara STAN (PKN STAN) dengan Program Studi jurusan Kepabeanan dan Cukai Diploma 1.  

Setelah perusahaan stanbrain ini di ambil alih oleh Fredy Napitupulu, perusahaan tersebut pun semakin berkembang dengan baik. Hingga pada tahun 2015 stanbrain telah berhasil membantu meluluskan peserta bimbingan belajar untuk masuk ke kampus PKN STAN. Tidak tanggung-tanggung peserta yang berhasil lolos pun lebih dari 200 peserta, angka tersebut merupakan pencapaian tertinggi untuk pertama kalinya setelah bisnis pelatihan dan bimbingan belajar tersebut di ambil alih oleh Fredy Napitupulu.

Pada Tahun 2018, Stanbrain secara resmi dibina dan diawasi langsung oleh Bapak Suyono Salamun, beliau merupakan ex Direktur STAN (1997-2008). Tidak hanya itu, stanbrain pun mendapatkan pengakuan dari lembaga pendirian satuan pendidikan non-formal, dan mendapatkan izin operasional lembaga kursus pelatihan dengan Nomor Induk Berusaha 81920117123701 Kode KBLI 85495 dengan Brandnya PT. STANBRAIN PENDIDIKAN INDONESIA.

Di tahun 2019 Stanbrain telah memiliki 42 Cabang di seluruh Indonesia. Salah satu cabang Stanbrain yang berada di kota-kota besar yaitu di Bintaro, Yogyakarta, Bandung, Surabaya dan Denpasar. Dengan jumlah cabang Stanbrain tersebut membuat stanbrain meraih jumlah kelulusan lebih dari 3.200 siswa yang berhasil masuk ke Kampus PKN STAN.

Seiring dengan perkembangan era digital saat ini Stanbrain pun menawarkan inovasi terbaru dalam hal bimbingan belajar, yaitu dengan menyediakan fasilitas bimbingan belajar secara online dengan aplikasi yang diberi nama Stanbrain Apps. Stanbrain Apps sendiri merupakan satu-satunya aplikasi yang dibuat oleh beberapa team terbaik dari Stanbrain yang telah mensukseskan Stanbrain Pendidikan Indonesia.

Tidak lama setelah peluncuran Aplikasi Stanbrain Apps, Stanbrain pun mulai berkembang kembali yang sebelumnya hanya bertujuan khusus untuk persiapan masuk Kampus PKN STAN, kini menjadi Bimbingan Belajar khusus Persiapan UTBK, CPNS, PKN STAN, dan Kedinasan Lainnya.